天元宗众人回到宗内后，开始研究石碑上的符文。石月生和叶瑶每日都在古籍阁中查找资料，试图解读其中秘密。
然而，平静并未持续太久。一日，石月生在回住所途中，竟被一群弟子拦住，为首的是墨无痕。
“石月生，你屡次惹事，让我们天元宗陷入危机，你可知罪？”墨无痕满脸不屑。
石月生皱眉：“墨无痕，我所做之事皆是为了对抗黑暗势力，何来惹事一说？”
“哼，别狡辩了，若不是你，炎火宗怎会与我们为敌？还有那灵音谷之事，谁知道是不是你招来的麻烦。”墨无痕身旁一名弟子附和道。
石月生怒视他们：“你们不明事理，被黑暗势力蒙蔽了双眼。”
双方正僵持时，叶瑶赶来：“你们在干什么？现在不是起内讧的时候，黑暗势力还在虎视眈眈。”
墨无痕冷笑：“叶瑶师姐，你别被他骗了，他就是个灾星。”
叶瑶正要反驳，一位太上长老出现，他是墨无痕的父亲。“石月生，你的所作所为老夫都看在眼里，你太冲动了，给宗内带来诸多隐患。”
石月生恭敬行礼：“太上长老，弟子所行虽有风险，但都是为了宗门安危。此次我们发现圣殿和炎火宗勾结，若不主动探查，我们只会更加被动。”
太上长老却不听解释：“休要狡辩，即日起，你和叶瑶不得再参与对抗黑暗势力之事，在宗内思过。”
石月生和叶瑶心中愤懑，但也只能领命。回到住所，石月生一拳砸在墙上：“他们怎么能这样？分不清是非黑白。”
叶瑶安慰道：“师弟，别气了，我们先找出证据，证明我们的清白。”
就在这时，石月生收到一封匿名信，信中提到宗内有内鬼，与黑暗势力勾结，还暗示墨无痕父子与此事有关。
“师姐，看来事情没那么简单，我们得暗中调查。”石月生眼神一凛。
两人决定先从墨无痕父子的行动入手。经过几日观察，他们发现墨无痕经常在深夜前往一处偏僻的山谷，行踪可疑。
一天夜里，石月生和叶瑶悄悄跟在墨无痕身后。只见墨无痕在山谷中与一名黑袍人会面。
“事情办得怎么样了？”黑袍人问道。
墨无痕恭敬地回答：“放心，我已经按照你们的吩咐，让我父亲阻止石月生他们继续调查，下一步该怎么做？”
黑袍人满意地点头：“很好，你设法拿到灵音谷那块石碑，那对我们的计划至关重要。”
石月生和叶瑶听到这里，心中大惊。他们决定先回宗内，将此事告知宗主。
可当他们回到宗内，却发现宗主正在大发雷霆，原来是混元灵珠不见了。
“一定是内鬼所为。”石月生说道。
宗主看向他们：“你们可有什么线索？”
石月生将墨无痕与黑袍人会面之事说出。宗主立刻下令捉拿墨无痕父子。
墨无痕父子被带到大殿，面对指控，墨无痕还想狡辩：“宗主，这是污蔑，我没有与黑暗势力勾结。”
石月生拿出证据：“我们亲眼所见，你还想抵赖？”
墨无痕无话可说，太上长老却道：“即便如此，也不能证明老夫参与其中。”
这时，一名弟子前来禀报：“宗主，在墨长老的住所发现了与黑暗势力通信的信件。”
太上长老脸色一变，知道大势已去。原来，他被黑暗势力利诱，为了获取强大的力量，背叛了天元宗。
宗主痛心疾首：“你们父子二人，为了一己私欲，竟做出如此大逆不道之事，当受重罚。”
处理完墨无痕父子后，石月生和叶瑶继续研究石碑。经过多日努力，他们终于在古籍中找到一些线索，似乎石碑与一种古老的封印术有关。
“如果我们能解开石碑的秘密，或许就能找到克制黑暗势力的方法。”叶瑶兴奋地说。
但就在这时，圣殿和炎火宗再次发动攻击。他们得知天元宗内乱，想趁机一举攻破。
天元宗弟子纷纷应战，石月生和叶瑶也加入战斗。石月生面对众多敌人，施展出“分光剑法”的新招式“分光幻影斩”，瞬间击退一片敌人。
叶瑶则施展“藤蔓囚天术”的升级版“万藤绞杀阵”，困住了不少炎火宗高手。
圣殿的黑袍首领看到这一幕，亲自冲向石月生：“小子，这次你逃不掉了。”
他施展出更强的“黑暗灭世掌”，石月生感受到巨大的压力，全力施展“灵力护盾”和新学的“御剑术”抵挡。
叶瑶见状，想要过来帮忙，却被炎火宗宗主缠住。“小丫头，你的对手是我。”炎火宗宗主施展“炎龙啸天功”的强化版“九龙焚天术”，九条火焰巨龙朝着叶瑶扑去。
叶瑶施展“五行防御阵”和“灵火咒”的融合法术“灵火五行盾”，艰难抵御。
石月生这边，黑袍首领攻势越来越猛，他找准机会，一道“黑暗裂空斩”朝着石月生劈来。石月生躲避不及，被击中，口吐鲜血。
“师弟！”叶瑶心急如焚，不顾自身安危，冲向石月生。
黑袍首领见状，准备再次出手。就在这危急时刻，天元宗宗主赶到，他施展