以下一个道馆所在地滨海市为目标的小智一行人在旅途中遇到了突发状况...
小智右手上的光明石在疯狂闪耀，并且在冥冥之中指引着小智前往某个地方...
“小智你手上的光明石怎么闪个不停？”小刚疑惑道。
“我也不知道，但是我能感受到光明石似乎想指引我去某个地方。”小智不确定的说道。
“既然如此我们就跟着光明石的指引行动吧，说不定等到我们到达目的地后就能解开谜题了。”小刚建议道。
“嗯~”小智重重的点了点头，随后便跟着光明石的指引，朝着某座小镇的方向奔去。
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白杨镇主区位于湖泊中心的高原上，有大桥连接着高原和大陆，城镇四周有树木茂盛的山丘及高原，而白杨镇中心有一座时空之塔，是镇上最大的乐器也是会场，而时空之塔后方有一座庭院，里面生活着各种各样的宝可梦...
而如今的白杨镇变成了一片废墟，就连白杨镇中心的时空之塔也没有幸免于难...
“这里究竟发生了什么事情？为什么白杨镇会变成这副模样？”小刚惊讶的看着眼前的废墟。
“是黑暗使者搞的鬼！”小智皱眉看着飘荡在废墟空中的黑暗气息。
“黑暗使者？你是说毁灭这座小镇的是黑暗使者？”小霞问道。
“嗯~在空气中还残留着黑暗气息。”小智点了点头回答道。
“可是黑暗使者为什么要毁灭白杨镇？”小刚对此感到非常疑惑。
“那是因为黑暗使者想要抓捕帝牙卢卡和帕路奇亚，而白杨镇的毁灭只是因为战斗的余波所造成的。”一道黑色的身影出现在众人眼前。
“达克莱伊？！”小刚认出眼前宝可梦的身份。
“是我。”达克莱伊点了点头。
“达克莱伊你受了好重的伤。”小智急忙来到达克莱伊身边，想用光明之力为它治疗。
达克莱伊见状急忙与小智拉开距离，并摇了摇头说道:“我不碍事，你不能将光明之力浪费在我身上，因为有一件事需要你去办，而光明之力是不可缺少的力量。”
“就算在接下来的事情需要光明之力，但不耽误用光明之力为你治疗吧？以我目前的能力就算为你治疗也消耗不了多少体力的，就算消耗了体力睡一觉就恢复了。”小智有些不理解。
“因为接下来的事情十分紧急，并没有时间让你恢复光明之力。”达克莱伊回答道。
“难不成帝牙卢卡和帕路奇亚被黑暗气息给侵袭了？”小智根据达克莱伊的话做出某种猜测。
“没错~在半个月前，黑暗使者来到了此处，因为黑暗气息的缘故在他踏入白扬镇的那一刻，帝牙卢卡和帕路奇亚便出现在时空之塔，想要一举歼灭黑暗使者。”
“但令人没想到的是...黑暗使者利用黑暗魔种彻底魔化了洛奇亚，并控制它与帝牙卢卡和帕路奇亚战斗。”
“这一场战斗足足维持了七天七夜，然而在战斗过程中帝牙卢卡和帕路奇亚受到黑暗魔种的污染。”达克莱伊回答道。
“黑暗魔种那是什么？居然能够污染帝牙卢卡和帕路奇亚。”小霞疑惑道。
“黑暗魔种是由黑暗之力和黑暗阿尔宙斯的力量所凝结而成的，被黑暗魔种所污染的宝可梦可被操纵者所控制。”小智解释道。
“啊？黑暗之力居然这么bug的吗？难道没有办法净化污染吗？”小霞问道。
“有，用我的光明之力就可以彻底净化黑暗魔种的污染，但这个前提是...没有被黑暗魔种彻底污染，如果被黑暗魔种彻底污染的话，哪怕用光明之力也无法彻底将其清除。”小智解答道。
“因为被黑暗魔种彻底污染的宝可梦，已经是新品种的宝可梦了，这就是黑暗阿尔宙斯的能力之一黑暗侵袭，因为它的本体被镇压在炎火山脉，所以它只能借用黑暗之力凝聚出黑暗魔种来污染宝可梦。”达克莱伊补充道。
“所以需要小智利用光明之力来清除帝牙卢卡和帕路奇亚身上的黑暗之力？”小刚问道。
“没错~”达克莱伊点了点头。
“那帝牙卢卡和帕路奇亚现如今在什么地方？”小智问道。
“帝牙卢卡在黑暗之力侵蚀在心智的那一刻，利用时间之力将帕路奇亚送到15年后城都地区，而它自己则是前往远古时期的神奥地区，也就是洗翠地区。”达克莱伊回答道。
“也就是说想要拯救帝牙卢卡和帕路奇亚必须前往15年后和洗翠地区？”小刚问道。
“没错~不过你需要注意的是...黑暗使者和黑暗洛奇亚也同样前往了15年后，你前往未来后说不定会和黑暗使者碰面。”达克莱伊提醒道。
“放心吧~我会注意的，不过我该如何前往15年后和洗翠地区？”小智问道。
“我会利用帝牙卢卡赐予我的时间之力将你送到15年前，等你将事情解决后自然会将你送到洗翠地区。”达克莱伊回答道。
“我明白了~达克莱伊请你帮我传送到15年后，我会尽我所能去拯救帕路奇亚的。”小智认真的说道。
“不过在你前往