故此，马仲英特意令郭从后营选了一批会绣工的妇人，让她们替琼州军赶制一批军旗、营旗以及队旗。
根据马仲英的授意，琼州军的军旗，依旧用明朝的日月旗，只是在日月图案旁边，用金线绣上琼州军三个一尺长的大字。
营旗则采用黑色为底色，然后在黑旗上分别用红线绣上麒麟、白虎和玄武三种神兽，并用金线注明军名、营名。
队旗则和营旗一样，但相比于营旗要小上一号，并在旗帜上用金线注明该旗是哪支步队，这样做的目的就是为了在后面的战斗中，各营、队能够做到旗帜鲜明，进退有据，毕竟这个时代作战，主要是依靠旗语传递信息。
重新整编，制作旗帜并不是一蹴而就的事，故马仲英决定趁着重新整训得空挡犒赏三军。