公大臣皆已降周，但是慕容三藏仍然率领禁卫抵抗攻入宫中的周军，直到北齐灭亡以后，给关在牢房里的慕容三藏才顺势归顺北周王朝。
隋朝建立后，杨坚授慕容三藏吴州刺史之职、加封他为野王县开国县公，接着又让他出任凉州（武威郡）刺史、凉州道黜置大使。到了开皇九年，他作为襄阳郡公韦洸副手远征岭南。由于在阵前指挥大军作战的韦洸中流矢而亡，杨坚便让慕容三藏总领军事、检校广州道行军总管、检校广州都督等职。
岭南平定以后，慕容三藏入朝任大将军之职，但是过了不了多久，廓州便时常遭到吐谷浑不断袭扰，杨坚鉴于慕容三藏对凉州地形异常熟悉，立刻任命他为廓州刺史，为大隋茂守边疆。他在州内招抚境内、吏民安业，在对外作战方面，多次击溃了入寇廓州的吐谷浑军，为大隋王朝立下赫赫功勋。杨广登基后，加封他为加金紫光禄大夫、迁凉州兵曹。
兵曹其实是以处理军务为主，但是慕容三藏大半辈子南征北战、东征西讨，根本就闲不住，也没有耐心坐在官署中处理如山的军务。征得杨集同意后，索性就不管那些军务了，专门跑来军营之中练兵，当起了凉州的练兵大将。
慕容三藏或许是当“文官”太久、压抑太久，当他接到练兵的新任务，宛如枯木逢春一般，每天都是精力旺盛，努力将自己作战心得传授给将士们。
哪怕他现在面对的是一群自战场上归来的士兵，可是他也不厌其烦的传授这些最基本的战场常识：
“骑兵的强悍之处在于强悍的力量，而这股强大的力量来自哪里？不是马背上的人，而是屁股而不是人。但是战马再怎么聪明，也是一个不会说话的牲口。所以你们要做的便是一次次的训练、学会怎么去配合它，借助它的冲势、借助它的颠簸来使力，只要做到这一步，那便是初步的人马合一。”
“你们还有一个致命的缺点，那就是在冲刺的时候，将自身力量用死，这其实并没有多大意义。因为骑兵在急速冲击之下，全力出手的力量比没有战马时，至少多出了一半，也就是说，你们在马背上作战时，只要使用一半、或四成的力量就够了。但是很多人生怕杀不死敌人，于是使全力刺出手中的武器。威力固然是大了很多，但是想要重新聚力、或是收回武器，又要耗费很多时间，而疾冲的战马、敌人却不会给你们拔出武器的时间，所以骑兵在战场上杀敌之时，至少要留三分劲力，这样才能做到游刃有余、连绵不绝。”
“当然了，在两名骑后相对而冲的情况下，双马的战马产生出来的力量，比一个人至少多出一倍，有时候你们哪怕留下三分劲力，也会使深深的楔入对方的身体之中，像马槊、长矛、长枪这种武器是不可能拔得出来的，所以这个时候，你们要松开手中的长兵器，拔出战马砍下对方的手臂，千万要记住，战刀砍的是手臂，而不是首级。”
“为什么砍手臂，而不是首级？因为对方长兵器错过你身体的时候，也想用战刀杀死你，当你斩下对方首级之时，其实他还没有彻底死去，手中的战刀还保持着砍你的姿势，在战马添加的速度之下，没有头颅的尸体的战刀还能杀死你、砍伤你。”
“你斩下对方的手臂之后，两马交错而过，这个时候你要做的事情，是从对方的背后抽出你的长兵器。这么借马势一带，你的长兵器就这么透体而出了，之后，又能顺势捅向后面那个，而你另外一只手上的战刀，既可格挡敌军的武器、也能砍下他的手。……”
“虽说战后以首级记功，但战场之上都是杀敌为重，这个时候千万不要为了一颗人头，把自己置于死地……”
慕容三藏说完这番话，也没有骑上杨集送给自己的汗血宝马，而是随意牵来一匹战马，他身手敏捷的坐上马背，驭马在校场中驰骋，将战马的速度提升到了极致，马槊顺着冲击力猛击而出，一个固定的木头人让他一槊穿透了过去。
他的汹涌攻势不停，一槊接着一槊，一口气刺倒了十个木头人方才停顿下来，然后调转马头，来到军阵之前，大声吼道：“对了，就是这样！骑兵就有拥有藐视一切的魄力，不管你的面前是千军万马，还是刀山火海，你都要毫无顾忌的冲过去，只有把面前的所有敌人碾碎，那你才能坚持到最后，如果你畏缩不前的话，你后面的骑兵也会把你撞倒。所以战场之上，骑兵有进无退、非生即死。”
“你们要想从战场上活回来，唯一的办法就是平时多训练，我说的训练不单是训练你们的体力，与战马、武器、铠甲熟悉程度，还有一往无前的胆魄！”
谷旱
“呜呜呜呜”苍凉悠长的号角声响起，校场上的骑兵在各自将领的带领下，一分为二，两支遥遥相对的军队很快便组成了一个个整齐的骑兵方阵，渐渐汇聚成两个铺天盖地的进攻大方阵。
两军纵队间的间隙比较宽，而且还是错开的，这是慕容三藏为了训练将士们胆魄，准备让两军对冲，两军从对方的缝隙中交错而过，既能感受到大量骑兵作战的威势，又不至于撞到一处，同时也是在训练将